<div dir="ltr">Hi all,<div><br></div><div>I am currently working on the following task. I got two DICOM series from different modality with different spacing, and origin. A third DICOM serie correspond to binary segmentation of one the previous serie. I would like to "project" this segmentation into the other serie. I think that the resampling filter should make this work quite well. It should look something like that:</div>
<div><br></div><div><div>  ResampleFilterType::Pointer resampler = ResampleFilterType::New();</div><div>  resampler->SetInput( maskVolume->GetOutput() );</div><div>  resampler->SetTransform( transform );</div><div>
  resampler->SetInterpolator( interpolator );</div><div>  resampler->SetOutputOrigin( targetVolume->GetOutput()->GetOrigin() );</div><div>  resampler->SetOutputSpacing( targetVolume->GetOutput()->GetSpacing() );</div>
<div>  resampler->SetOutputDirection( targetVolume->GetOutput()->GetDirection() );</div><div>  resampler->SetSize( targetVolume->GetOutput()->GetLargestPossibleRegion().GetSize() );</div><div>  resampler->Update();</div>
</div><div><br></div><div>However, I got trapped with what seems to be a problem of origin. I search around and different discussions and got quite confused. From what I found is the following:</div><div>Using gdcminfo to read the origin of targetVolume will give me the same information than the tag (0020,0032) of the DICOM header. However, it will be different from targetVolume->GetOuput()->GetOrigin() which imply a shift when saving my data later.</div>
<div><br></div><div>What should the proper way to do such task?<br clear="all"><div><br></div><div>Thanks in advance,</div><div><br></div><div>Best regards,</div>-- <br><div dir="ltr"><div><span style="font-family:'Times New Roman';font-size:medium"><table style="width:638px" border="0" cellpadding="0">
<tbody><tr style="height:37.5pt"><td style="width:228px;height:37.5pt;padding:0.75pt" align="left" valign="top"><b><span style="font-family:Arial,Helvetica;font-size:8pt">LEMAÎTRE Guillaume</span><span style="font-size:8pt;font-family:Helvetica"><br>
</span><font size="1"><span style="font-family:Arial">PhD Candiate<br>MSc Erasmus Mundus ViBOT (Vision-roBOTic)<br></span></font><span style="font-size:7.5pt;font-family:Arial" lang="EN-GB"><font color="#000000">MSc Business Innovation and Technology Management (in progress)<br>
</font></span></b><span style="font-size:7.5pt;font-family:Arial" lang="EN-GB"><b><br></b><font color="#0DB02B"><a href="mailto:g.lemaitre58@gmail.com" target="_blank">g.lemaitre58@gmail.com</a><br><br></font></span><p></p>
</td><td style="width:400px;height:37.5pt;padding:0.75pt" align="left" valign="top"><span style="font-size:8pt"><b><span style="font-family:Arial,Helvetica"><font color="#000000">ViCOROB - Computer Vision and Robotic Team</font></span></b></span><span style="font-size:7.5pt;font-family:Arial"><font color="#000000"><br>
Universitat de Girona, Campus Montilivi, Edifici P-IV 17071 Girona<br>Tel. +34 972 41 98 12 - Fax. +34 972 41 82 59 </font></span><br><span lang="EN-GB"><a href="http://vicorob.udg.es/" style="font-family:Arial;font-size:7.5pt" target="_blank">http://vicorob.udg.es/</a><br>
<font color="#000000"><b><font face="Arial, Helvetica"><span style="font-size:11px">LE2I - Le Creusot</span></font><br></b><font face="Arial" size="1">IUT Le Creusot, Laboratoire LE2I, 12 rue de la Fonderie, 71200 Le Creusot<br>
Tel. +33 3 85 73 10 90</font></font><span style="font-family:Arial;font-size:x-small"> - Fax. +33 3 85 73 10 97</span><span style="font-family:Arial;font-size:x-small"> </span><span style="font-family:Arial;font-size:x-small"><br>
</span><span lang="EN-GB" style="font-family:Arial;font-size:7.5pt"><a href="http://le2i.cnrs.fr" target="_blank">http://le2i.cnrs.fr</a></span></span></td></tr></tbody></table></span></div><div style="text-align:left"><img src="https://sites.google.com/site/glemaitre58/_/rsrc/1340103962984/config/le2i.png">  <img src="https://sites.google.com/site/glemaitre58/_/rsrc/1340103388011/config/vico.png">  <img src="https://sites.google.com/site/glemaitre58/_/rsrc/1340103887254/config/ub.png">  <img src="https://sites.google.com/site/glemaitre58/_/rsrc/1340103809482/config/udg.png">  <img src="https://sites.google.com/site/glemaitre58/_/rsrc/1340104225210/config/vibot.png"></div>
<a href="https://sites.google.com/site/glemaitre58/" target="_blank">https://sites.google.com/site/glemaitre58/</a><br>Vice - Chairman of A.S.C. Fours UFOLEP<br>Chairman of A.S.C. Fours FFC<br>Webmaster of <a href="http://ascfours.free.fr" target="_blank">http://ascfours.free.fr</a></div>

</div></div>