<div dir="ltr"><br><div class="gmail_extra"><br><br><div class="gmail_quote">On Thu, Mar 6, 2014 at 10:25 PM, Gib Bogle <span dir="ltr"><<a href="mailto:g.bogle@auckland.ac.nz" target="_blank">g.bogle@auckland.ac.nz</a>></span> wrote:<br>
<blockquote class="gmail_quote" style="margin:0px 0px 0px 0.8ex;border-left-width:1px;border-left-color:rgb(204,204,204);border-left-style:solid;padding-left:1ex">




<div>
<div style="direction:ltr;font-size:10pt;font-family:Tahoma">Thanks.  I have tracked down the reason for the crash reading this compressed tiff in Windows.  The compression is DEFLATE (AKA ZIP).  The function TIFFReaderInternal::CanRead()
 in itkTIFFImageIO.cxx checks for COMPRESSION_NONE, COMPRESSION_PACKBITS and COMPRESSION_LZW, although COMPRESSION_DEFLATE is covered elsewhere in the code.  I added this line:<br>
|| this->m_compression == COMPRESSION_DEFLATE<br>
and now the read proceeds successfully, as far as I can tell, and my program creates an uncompressed 4.5GB file.   This is progress!<br></div></div></blockquote><div><br></div><div>Well done!  Any patches [1] are greatly appreciated :-)</div>
<div> </div><blockquote class="gmail_quote" style="margin:0px 0px 0px 0.8ex;border-left-width:1px;border-left-color:rgb(204,204,204);border-left-style:solid;padding-left:1ex"><div><div style="direction:ltr;font-size:10pt;font-family:Tahoma">

<br>
Unfortunately the file that is created does not identify itself as a valid TIFF. 
<br>
Irfanview says: Decode error!  Invalid or unsupported TIF file.  <br>
When I try to read it with ITK, the message is:<br>
File: ...itkImageFileReader.hxx<br>
Line: 143<br>
Description: Could not create IO object for file preeq_u.tif<br>
Tried to create one of the following:<br>
JPEGImageIO<br>
...<br>
TIFFImageIO<br>
...<br>
You probably failed to set a file suffix, or set the suffix to an unsupported type.<br>
<br>
Well, the suffix is obviously correct, so there is another problem with the file.<br>
<br>
The saga continues...<br></div></div></blockquote><div><br></div><div>Keep up the good fight :-),</div><div>Matt</div><div><br></div><div><br></div><div> [1]  <a href="http://insightsoftwareconsortium.github.io/ITKBarCamp-doc/CommunitySoftwareProcess/SubmitAPatchToGerrit/index.html">http://insightsoftwareconsortium.github.io/ITKBarCamp-doc/CommunitySoftwareProcess/SubmitAPatchToGerrit/index.html</a></div>
</div></div></div>