<div dir="ltr"><div><div><div><div>Hello all,<br><br></div>I am trying to code some registration stuff from scratch using itk. So, I have a dense deformation field and I can compute various similarity measures and now I want to regularize the deformation to ensure smooth deformations.<br>
<br></div>From the literature, it seems one of the simple things to do is penalize the magnitude of the second derivative of the deformation. I see there are gradient filters available and I guess for the second derivative, I can pass the deformation field image to two gradient filters in succession and then compute the magnitude. However, I would like to use a mask in my computation. So areas under the mask should only be used and forward or backward differences should only be used at the edges, as appropriate.<br>
<br></div>Is there a way to achieve this through existing filters?<br><br></div>Thank you for any help you can give me.<br><br><div><div><div><div><div><br>Cheers,<br><br>Anja
</div></div></div></div></div></div>